Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF17Q9BXT8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF17Q9BXT8 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms