Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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