Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUSD3Q96L08 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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SUSD3Q96L08 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SUSD3Q96L08 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SUSD3Q96L08 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD3Q96L08 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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