Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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