Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms