Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms