Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms