Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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