Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms