Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARRDC4Q8NCT1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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