Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms