Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM139Q8IV31 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM139Q8IV31 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms