Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms