Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms