Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms