Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms