Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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