Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms