Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms