Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms