Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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