Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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GBX1Q14549 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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GBX1Q14549 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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