Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCNIQ14094 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms