Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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