Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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