Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TCIRG1Q13488 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TCIRG1Q13488 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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