Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 624 ms