Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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