Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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AP3B2Q13367 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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AP3B2Q13367 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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AP3B2Q13367 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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AP3B2Q13367 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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