Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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