Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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