Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXF2Q12947 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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