Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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