Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms