Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms