Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3F3AP84243 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3F3AP84243 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms