Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms