Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms