Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms