Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMAN1P49257 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms