Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ME1P48163 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ME1P48163 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ME1P48163 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms