Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms