Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AFMP43652 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AFMP43652 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms