Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPD3P42695 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPD3P42695 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms