Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms