Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms