Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OTX2P32243 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OTX2P32243 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms