Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KDM5AP29375 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KDM5AP29375 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KDM5AP29375 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KDM5AP29375 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KDM5AP29375 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KDM5AP29375 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms