Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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