Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PSMB4P28070 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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